W 1980 skończyła studia w Studiu Wokalno-Aktorskim im. Baduszkowej w Gdyni, a w 1984 ukończyła PWST we Wrocławiu. W 1984 zadebiutowała w Teatrze Ateneum w Warszawie. Od tamtej pory na stałe związała się z sceną teatralną, głownie z teatrami warszawskimi. W 1984-1985 występowała w Teatrze Powszechnym w Warszawie, w latach 1985-1989 w Teatrze Ateneum. Potem związana była z teatrem Nowym (1991-1994) i Ochotą (1998-2003). Anna Wojton przez trzy lata mieszkała w Sztokholmie. Aktorka występowała także w wielu serialach, np. Na Wspólnej (2003), M Jak Miłość (2005), Pierwsza miłość (2007), Klan (2008), Na dobre i na złe (2008) oraz Samo życie (2009). W Capitolu gra w sztuce „Klimakterium 2”.